В настройках для админов сайта вроде нет ограничений на размер файла заливаемого через файловый менеджер(да точно не стоит, выставлено 0, и коммент что нет ограничений на размер файла). Однако когда я захожу на сайте в файловый менеджер, чтобы загрузить на сайт файл с компа, мне пишет что Максимальный размер загружаемого файла - 2 MB

Что и где надо подкрутить, чтобы избавится от этого ограничения?

Это ограничение сервера, правится в php.ini
> upload_max_filesize = 2M

Можете либо потыкать хостера или если хостер позволяет, можете добавить в .htaccess следующую строку
php_value post_max_size 30M
где 30M, желаемый максимальный размер загружаемого файла.

Screatch Спасибо за наводку, попробую саппорт хостера потеребить. Вообще, мне треба максимум выставить не на 30 метров, а где-нибудь на гиг. Тарифом предусмотрен анлим траффик и дисковое пространство.
Как думаете хостер пойдет на встречу?

Гиг точно нет. Такими файлами можно и сервер повесить, больше 128мб скорее всего никто не будет ставить.
Что за сайт у вас такой где требуется загрузка файлов размером с гиг через PHP?

Не требуется, просто хотелось бы предоставить некоторым "особенным" пользователям возможность к более-менее нормальному файлообмену. Нередко мувики хорошего качества, но не большой длительности(относительно не большой), весят по 600-800 метров(хотя дело случая где-то меньше, где-то больше) Но 1GB на большинство случаев было более чем предостаточно.

Можете потыкать хостера но я бы не расчитывал на положительный ответ с его стороны.

Попытка - не пытка.